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許多遊戲擁有數量驚人的不同結局。《地鐵逃生2：切爾諾貝利之心》雖然結局數量不多，但在遊戲結束字幕出現前，共有4種不同的結局。
玩家在《地鐵逃生2：切爾諾貝利之心》中將麵臨許多重要選擇。遊戲結局會因玩家在3個特定任務中做出的特定選擇而大相徑庭。以下列出每個結局以及玩家在關鍵任務中需要做出的關鍵對話選擇。
影響《地鐵逃生2》結局的選擇
在3個關鍵任務中，玩家將做出影響最終結局的選擇。這些任務包括“微妙的事務”、“危險的聯絡”和“最後的願望”。幸運的是，這些任務都在遊戲後期，這意味著玩家可以推進到“區域傳奇”，然後進行手動存檔。這樣，他們就可以體驗所有可能的結局，而無需重玩整個遊戲。
她永遠不會自由
- 微妙的事務：生命在於當下
- 危險的聯絡：[逃跑]
- 最後的願望：[開火]
斯特洛克希望保護區域，因此做出旨在實現這一目標的選擇將使玩家與斯特洛克站在一起，並讓他們控製區域。玩家隻需要與所有其他派係為敵才能走上這條道路。這包括拒絕疤痕，逃離科爾舒諾夫，並射殺凱曼諾夫。斯特洛克是過去遊戲中出現過的另一個角色，非常值得了解他們的背景故事。
Y計劃
- 微妙的事務：生命在於當下
- 危險的聯絡：[逃跑]
- 最後的願望：[放下槍]
對於下一個結局，玩家需要重複與上一個結局相同的選擇。但是，他們不會射殺凱曼諾夫，而是放下槍並與他站在一起。他是一位科學家，希望看到如果區域被放任自流會變成什麼樣，並且它有權不受任何人的控製。
永無止境
- 微妙的事務：永恒的春天
- 危險的聯絡：[逃跑]
- 最後的願望：
《地鐵逃生2》中另一個可怕的派係是火花。該派係由該係列過去遊戲之一《地鐵逃生：晴朗天空》的主角疤痕領導。幫助疤痕將導致他進入一個他認為會將他帶到閃耀區域的艙室。雖然一些任務要求你在所有這三個重要任務中做出選擇，但火花結局隻需要玩家在其中兩個任務中做出選擇。
美麗新世界
- 微妙的事務：生命在於當下
- 危險的聯絡：我不是你的敵人
- 最後的願望：N/A
《地鐵逃生2：切爾諾貝利之心》中有很多派係，其中之一是守衛。做出這些選擇將使玩家與克魯什諾夫上校站在一起，開展一場徹底摧毀區域的行動。與火花結局一樣，在做出選擇時，隻有兩個任務很重要。
