Ведущий разработчик Assassin's Creed Shadows уверяет игроков, что выбор одного главного героя не повлияет на их опыт. В игре участвуют два игровых персонажа: Naoe, женский шиноби и Yasuke, исторический африканский самурай, выбор, который вызвал обсуждение перед выпуском.
Возникла опасения, что сосредоточение внимания на одном персонаже может привести к отсутствию важных моментов сюжета или игрового процесса. Креативный директор Джонатан Дюмон рассмотрел эти проблемы, описывая свой собственный сбалансированный подход: «Я обычно переключаюсь между персонажами, может быть, 3-5 часов с одним, затем 2-3 с другим».
Тем не менее, Дюмонт пояснил, что игроки не будут оштрафованы за предпочтение одного персонажа. В то время как каждый главный герой может похвастаться уникальными вступительными последовательностями и личными сюжетными линиями, повествование игры адаптируется к выбору игрока. Он призывает игроков играть за своего предпочтительного персонажа: «Вы не будете сильно пропустить. Это зависит от вашего стиля игры. У каждого есть уникальные представления и квесты, но основной опыт адаптируется. Выберите свой любимый; история приспосабливается».